PEPTIDE BOND FORMATION OR TRANSPEPTIDATION REACTION

 PEPTIDE BOND FORMATION OR TRANSPEPTIDATION REACTION ::

The alpha amino group of incoming amino acid in the A site forms a peptide bond with carboxyl group of amino acid of the peptidyl t-RNA on P site This reaction is catalysed by enzyme peptidyl trangerase here in transpeptidation reaction growing peptide chain is transferred from P site to A site Chloramphenicol by acting as a peptide analogue prevents traspeptidation Paromomycin an another amino acid analogue cause premature termination of peptide chain 

e TRANSLOCATION 

Here whole ribosome moves over the m -RNA at the distance of one codon (3- bases) Peptidyl t-RNA is translocated to P site A site is ready to receive another aminoacyl t-RNA The t-RNA from which peptide chain is removed is transferred from P site to E site and discharged from E site The translocation of peptidyl t-RNA from A site to P site is prevented by erythromycin spectinomycin and fusidic acid Due to this peptide chain may be prematurely terminated and synthesis of larger proteins may be suppressed 

f. TERMINATION 

When terminator codon comes on m-RNA termination of protein chain from ribosome occurs at end of protein synthesis 

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पेप्टाइड बॉन्ड गठन या ट्रांसपेप्टाइडेशन प्रतिक्रिया ::

A साइट में आने वाले अमीनो एसिड का अल्फा अमीनो समूह P साइट पर पेप्टाइडाइल t-RNA के अमीनो एसिड के कार्बोक्सिल समूह के साथ एक पेप्टाइड बॉन्ड बनाता है। यह प्रतिक्रिया एंजाइम पेप्टाइडाइल ट्रांजेरेस द्वारा उत्प्रेरित होती है। ट्रांसपेप्टाइडेशन प्रतिक्रिया में बढ़ती पेप्टाइड श्रृंखला P साइट से A साइट पर स्थानांतरित हो जाती है। क्लोरैम्फेनिकॉल पेप्टाइड एनालॉग के रूप में कार्य करके ट्रांसपेप्टाइडेशन को रोकता है। पैरोमोमाइसिन एक अन्य अमीनो एसिड एनालॉग है जो पेप्टाइड श्रृंखला के समय से पहले समाप्त होने का कारण बनता है।

ट्रांसलोकेशन

यहां पूरा राइबोसोम एक कोडन (3-बेस) की दूरी पर m-RNA पर चलता है। पेप्टिडाइल t-RNA को P साइट पर स्थानांतरित किया जाता है। A साइट एक और एमिनोएसाइल t-RNA प्राप्त करने के लिए तैयार है। जिस t-RNA से पेप्टाइड श्रृंखला हटाई जाती है उसे P साइट से E साइट पर स्थानांतरित किया जाता है और E साइट से डिस्चार्ज किया जाता है। पेप्टिडाइल t-RNA का स्थानांतरण ए साइट से पी साइट तक एरिथ्रोमाइसिन स्पेक्टिनोमाइसिन और फ्यूसिडिक एसिड द्वारा रोका जाता है। इसके कारण पेप्टाइड श्रृंखला समय से पहले समाप्त हो सकती है और बड़े प्रोटीन का संश्लेषण दबाया जा सकता है। एफ. समाप्ति जब टर्मिनेटर कोडॉन एम-आरएनए पर आता है तो राइबोसोम से प्रोटीन श्रृंखला की समाप्ति प्रोटीन संश्लेषण के अंत में होती है।